项目简介

10× Visium 空间转录组技术是一种结合组织空间位置信息与基因表达谱的高通量测序方法。其原理基于特殊载玻片上的空间条形码探针阵列：将新鲜冷冻组织切片贴合于载玻片后，通过组织透化释放mRNA，使其与邻近的带有唯一空间坐标的寡核苷酸探针结合，经反转录、建库及测序，将基因表达数据精准映射回原始组织切片的二维坐标，从而在保留组织结构的同时解析基因表达的空间分布特征。该技术广泛应用于肿瘤微环境研究（如癌细胞侵袭边界与免疫细胞互作）、 发育生物学（如胚胎器官形成中的基因表达梯度）、神经科学（如脑区特异性转录组图谱）以及疾病病理机制解析（如阿尔茨海默病淀粉样斑块周围基因调控网络），为揭示复杂组织中细胞异质性、空间功能分区及细胞间通讯提供关键技术支持。

送样要求

研究案例

       花器官的发育呈现出复杂的分子机制，涉及众多在不同组织及发育阶 段特化且精准发挥作用的基因的协同调控。空间转录组技术的进步使 得对空间定位的基因丰度进行定量测定成为可能，从而能够将花器官 发生的复杂情况与全基因组分子表型联系起来。 

       在此，研究人员将 10×Visium 技术应用于对蝴蝶兰（Phalaenopsis  Big Chili）这一兰花植物花器官发育形成过程的研究中。基于数千个 基因在高分辨率下的空间表达分布情况，研究者识别出了早期花发育 阶段的细胞类型，包括花序分生组织、花器官原基以及已确定特性的 组织。此外，研究者发现位于花器官基部位置的分生细胞在器官起始后的多个发育阶段持续发挥作用。尤为值得一提的是，通过著名的 MADS - box 基因以及许多其他下游调控因子，研究者揭示了花药的发育过程，其原基从单个位点开始，到后期发育阶段分化为包括花粉块及其他营养组织在内的多种细胞类型。空间转录组分析为理解花器 官发生的分子结构以及未来针对特定细胞类型开展基因组学和遗传学研究提供了全面的基因活性信息。

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