项目简介

m6A 甲基化RNA测序（m6A methylation RNA-seq） 是一种通过高通量测序检测 RNA 分子中腺嘌呤第六位氮甲基化修饰的技术。其核心原理是利用特异性抗体（如抗 m6A 抗体）免疫沉淀富集甲基化RNA 片段（如 MeRIP-seq 或 m6A-seq），或通过酶切结合交联（如miCLIP）定位 m6A 位点，结合测序分析甲基化修饰的分布及丰度。该 技术广泛应用于研究 m6A 在 RNA 代谢中的调控功能，包括 mRNA 剪 接（如调控选择性剪接因子结合）、稳定性（如影响 YTHDF2 介导的 降解）、翻译效率（如促进核糖体招募）及亚细胞定位（如应激颗粒形成）， 并揭示其在疾病中的作用，如癌症（如肿瘤干细胞干性维持）、神经 退行性疾病（如阿尔茨海默病中 Tau 蛋白 mRNA 异常修饰）和病毒感 染（如新冠病毒 RNA 修饰逃逸宿主免疫）。此外，m6A 在胚胎发育、 免疫细胞分化及植物逆境响应中的动态变化也为精准调控基因表达提 供表观转录组学依据。

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研究案例

基因组完整性维持在细胞存活中扮演着至关重要的角色。在这里，研 究者确定 RNA 去甲基化酶 ALKBH5 是一个关键的调节因子，它在活 性氧（ROS）诱导的应激期间保护细胞免受 DNA 损伤和凋亡。研究者 发现 ROS 通过调节 ALKBH5 的翻译后修饰（PTMs），显著诱导全局 mRNA N6- 甲基腺苷（m6A）水平，从而快速而有效地诱导数千个涉 及多种生物过程的基因，包括 DNA 损伤修复。从机制上讲，ROS 通 过激活 ERK/JNK 信号通路促进 ALKBH5 的 SUMO 化降低其底物可及 性，导致 ALKBH5 m6A 去甲基化酶活性受到抑制。此外，ERK/JNK/ ALKBH5-PTMs/m6A 轴在小鼠体内的造血干 / 祖细胞（HSPCs）中被 ROS 激活，表明这一分子途径在维持 HSPCs 基因组稳定性中的生理 作用。总的来说，研究者的研究揭示了涉及 ALKBH5 PTMs 和增加的 mRNA m6A 水平的分子机制，这些机制保护细胞基因组完整性以响应 ROS。

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